数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较(BLASTN)
蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较(BLASTP)
两序列比对(Align two sequences)
DNA序列分析——ORF Finder(.ncbi.nlm.nih/gorf/gorf.)
分析实验序列外显子部分——GENSCAN(genes.mitGENSCAN.)
分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter2.0 (tools.nebNEBcutter2.)
注: Custom digest -- view gel
限制性内切酶数据库——REBASE(rebase.nebrebaserebase.)
设计引物扩增实验序列——Genefisher
Primer 3
蛋白质序列分析及结构预测:
1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy(Compute pI/Mw)
2.分析蛋白质的基本物理化学性质:ExPASy(ProtParam)
3.分析蛋白质的亲水性和疏水性:ExPASy(ProtScale)
4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物:ExPASy(PeptideMass) [* :kinase K]
5.分析蛋白质的信号肽:ExPASy(SignalP)
6.预测蛋白质的二级结构:ExPASy(Jpred 3)
多物种分子系统发育分析:EMBL(.ebi.ac.ukembl)--Toolbox--Clustal2W
人脂联素蛋白质序列:NP_004788
人类胰岛素生长因子IB前体:P05019
内容来自网友回答
生物信息学想考研的话考什么好呢?国内江苏有什么值得推荐的较好的学校吗
额 国内开设生物信息学的学校非常非常少 江苏就我所知好像没有你可以去看看南京大学主页有没有 给你推荐几个好了 浙大复旦中科大这三所没的说离江苏也近 差点的吉林大学西北农林科技大学 其实建议出国 这行国内难以就业这是我看到很多人的亲身经历